تعتمد منظومة الإدارة البيئية فى مصر على تعاون العديد من الجهات المختلفة ، ومن أهم تلك الجهات مكاتب شئون البيئة بالمحافظات، حيث يكفل لها القانون العديد من الصلاحيات فى مجالات الإدارة البيئية. ، ومن هنا يأتى حرص وزارة الدولة لشئون البيئة على تفعيل منظومة لا مركزية الإدارة البيئية من خلال تطوير مكاتب شئون البيئة بالمحافظات وتحديد دورها وعلاقاتها بالفروع الإقليمية لجهاز شئون البيئة ومختلف وحدات الإدارت المحلية الأخرى.وقام جهاز شئون البيئة بالتعاون مع برنامج السياسات البيئية المصرى بتحديد أهم التحديات التى تؤثر فى أداء مكاتب شئون البيئة وأوجه التطوير التنظيمى والدعم الفنى للتغلب على تلك التحديات. كما يقوم الجهاز بدعم المبادرات التى يتم تنفيذها على المستوى المحلى بالمحافظات فى مجالات الإدارة البيئية وحماية البيئة.

وقد تم الإنتهاء من إنشاء خمسة فروع إقليمية ( القاهرة الكبرى والفيوم- غرب الدلتا- شرق الدلتا- وسط الدلتا- القناه وسيناء ) خلال المرحلة الأولى والثانية لمشروع إنشاء الفروع الإقليمية وشبكة الرصد البيئى الإقليمىبتكلفة تقدر بحوالى 45 مليون جنيه منها 924 مليون ين كمنحة من الحكومة اليابانية، وجارى حاليا العمل فى إنشاء ثلاثة فروع إقليمية تابعة للجهاز بمحافظات أسيوط- أسوان- البحر الأحمر لمعاونة محافظات شمال وجنوب الصعيد والبحر الأحمر فى متابعة تنفيذ خطط البيئة ومتابعة تنفيذ أحكام القانون 4/94 ولائحته التنفيذية ورفع الوعى البيئى بتكلفة تقديرية 35 مليون جنيه منها 55 مليون ين كمنحة يابانية، وقد وافقت هيئة المعونة اليابانية على البدء فى إجراءات استكمال المشروع الخاص بالإمداد بمعدات الرصد البيئى الإقليمى الثابتة والمحمولة والمتحركة لمعامل القياسات البيئية التابعة للفروع الثلاث، وتم إعداد خطة تعيين الكوادر اللازمة للفروع الثلاثة .

وخلال عام 2001 / 2002 تم التركيز على دعم القدرات المؤسسية للإدارة البيئية بالمحافظات ودعم دورها على مستوى المراكز والقرى وسوف تقوم الحكومة الدانمركية بتقديم الدعم لمحافظتى بنى سويف وأسوان لإعداد خطط العمل البيئية من خلال تنمية قدرات الإدارة البيئية فى هاتين المحافظتين لتنفيذ أنظمة الإدارة البيئية- وسيتم تعميم ذلك على باقى المحافظات من خلال برامج أخرى للدول المانحة مثل مشروع سيم SEAM.

وسوف يشهد العام القادم مبادرات أخرى لتحقيق لا مركزية الإدارة البيئية من خلال دعم مؤسسى للفروع الإقليمية للجهاز ولبعض مكاتب شئون البيئة بالمحافظات بدعم من البرنامج القطاعى(هيئة المعونة الدانمركية DANIA ). وفى إطار دعم لامركزية الإدارة البيئية والتعاون مع وزارة التنمية المحلية والمحافظات ، جارى حالياَ تنفيذ مشروعات دعم الإدارة البيئية ومكاتب شئون البيئة بمحافظات سوهاج وقنا ودمياط والدقهيلية وبنى سويف وأسوان والبحر الأحمر بالتعاون مع المعونة البريطانية والدنماركية وتنفيذ مشروعات إرشادية قليلة التكلفة بمشاركة المجتمع بهدف تحسين البيئة والظروف المعيشية خاصة فى المجتمعات النائية المحرومة من الخدمات.